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Titre :
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Les tests d'amplification en chaîne par polymérase (PCR) multiplexes et les panels syndromiques (2022)
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Auteurs :
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DECOUSSER JEAN-WINOC
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Dans :
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Hygiènes (Vol. XXX, n°4, septembre 2022)
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Article en page(s) :
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305-311
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Note générale :
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Fait partie de la rubrique ''Du côté du laboratoire'' ; photo du chargement d'un appareil de PCR en temps réel ; photo d'une centrifugation d'un échantillon biologique avant analyse ; tabl.I Exemples de tests génomiques multiplexes commercialisés et disponibles sous une forme automatisée ; réf. bibliogr.
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Langues:
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Français
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Mots-clés :
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Evolution
Hygiène
Innovation technologique
Laboratoire
Microorganisme
Modernisation
Polymère
Prélèvement
Test dépistage
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Résumé :
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Cet article aborde les tests PCR (ou Polymerase chain reaction1) réalisables directement sur un prélèvement clinique et ciblant différents pathogènes ou marqueurs en même temps. Ils sont regroupés sous le nom de PCR multiplexes : différentes cibles génétiques sont recherchées, amplifiées et détectées simultanément. Les micro-organismes recherchés en même temps peuvent être des bactéries, des virus, ou encore des champignons ou des parasites responsables d'un même syndrome (c'est-à-dire d'un ensemble de symptômes). Ces tests proposent des panels syndromiques d'amorces ciblant des agents infectieux (parfois associés à des gènes de résistance aux antimicrobiens ou à des gènes de virulence) à l'origine d'une même pathologie. L'auteur s'intéresse ici aux tests entièrement automatisés qui ont contribué à démocratiser cette technique dans de nombreux laboratoires. L'épidémie de Covid-19 a significativement renforcé la diffusion de ces tests dans les laboratoires de biologie, qui se sont largement équipés d'appareils permettant ce genre d'approche. Dans cette étude, sont exclus les tests PCR ne ciblant qu'un seul pathogène, même si plusieurs cibles sont incluses dans le réactif (par exemple : recherche des toxines de Clostridium difficile, recherche de Staphylococcus aureus et du gène de résistance à la méticilline). La quasi-totalité des réactifs de PCR commercialisés contiennent d'ailleurs un contrôle interne d'amplification qui fait d'eux des PCR multiplexes par définition. L'auteur s'intéresse néanmoins aux PCR multiplexes de détection des bactéries hautement résistantes et émergentes (BHRe), domaine d'intérêt particulier pour les hygiénistes. D'après la présentation de la revue. TC : TEST PCR
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